- mit Debora Gerstenberger und Constantin Goschler (Hg.): Intelligence Agencies, Technology and Knowledge Production. Data Processing and Information Transfer in Secret Services during the Cold War. London, New York 2022 (Studies in Intelligence)
- mit Jens Gieseke (Hg.): Communist Parties Revisited, Socio-Cultural Approaches to Party Rule in the Soviet Bloc, 1956-1991, New York: Berghahn Books, 2017
- Im "Generalstab der Partei". Organisationskultur und Herrschaftspraxis in der SED-Zentrale, 1946-1989, Berlin 2017 (= Kommunismus und Gesellschaft, 5), 584 S. (Habilitationsschrift)
- Die bellizistische Republik. Wehrkonsens und "Wehrhaftmachung" in Deutschland 1918–1933, München 2012 (Ordnungssysteme, Studien zur Ideengeschichte der Neuzeit, 43), 468 S. (Dissertation)
- mit Ralf Pröve (Hg.) Spießer, Patrioten, Revolutionäre. Militärische Mobilisierung und gesellschaftliche Ordnung in der Neuzeit, Göttingen 2010
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- Nachrichtendienstgeschichte in der Erweiterung? Neue Publikationen der Unabhängigen Historikerkommission zur BND-Geschichte, in: Neue Politische Literatur, 66 (2021), 2, S. 175-204
- Geschichte der Nachrichtendienste/Intelligence History, Version: 1.0, in: Docupedia-Zeitgeschichte, 05.01.2021 http://docupedia.de/zg/Bergien_geschichte_der_nachrichtendienste_v1_de_2021
- Programmieren mit dem Klassenfeind. Die Stasi, Siemens und der Transfer von EDV-Wissen im Kalten Krieg, in: Vierteljahrshefte für Zeitgeschichte, 67 (2019), 1, S. 1-30
- "Big Data" als Vision. Computereinführung und Organisationswandel in BKA und Staatssicherheit (1967–1989), in: Zeithistorische Forschungen/Studies in Contemporary History, 14 (2017), Nr. 2, 258–285
- Activating the 'Apparatchik.' Brigade Deployment in the SED Central Committee and Performative Communist Party Rule, in: Journal of Contemporary History 47 (2012), 4, 793–811
- The Consensus on Defense and Weimar Prussia's Civil Service, in: Central European History, 41 (2008), 2, 179–203
- Staat im Staate? Zur Kooperation von Reichswehr und Republik in der Frage des geheimen Grenz- und Landesschutzes, in: Vierteljahrshefte für Zeitgeschichte 56 (2008), 4, 643–678
- Fritz Fischers Thesen in Schulbüchern, in: Militärgeschichtliche Zeitschrift 64 (2005), 133–149
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- mit Debora Gerstenberger und Constantin Goschler: The knowledge of intelligence agencies in the Cold War world. An introduction, in: dies. (Hg.): Intelligence Agencies, Technology and Knowledge Production, S. 1–17
- Knowledge transfer and technopolitics. The CIA, the West German intelligence service and the digitisation of information processing in the 1960s, in: Bergien/Gerstenberger/Goschler (Hg.): Intelligence Agencies, Technology and Knowledge Production, S. 101–120.
- mit Debora Gerstenberger und Constantin Goschler: Conclusion, in: dies. (Hg.): Intelligence Agencies, Technology and Knowledge Production, S. 274–284
- Telefonpolitik in der Beschlussfabrik. Die Informalität des Entscheidens in der Machtzentrale der SED, in: Thomas Großbölting/Stefan Lehr (Hg.): Politisches Entscheiden im Kalten Krieg. Orte, Praktiken und Ressourcen in Ost und West, Göttingen 2020, S. 109-126
- Gründungsgewalt und Sicherheitskonsens. Die Geburt der Weimarer Republik aus einer Politik der »eisernen Faust«, in: Dieter Storz/Frank Wernitz (Hg.): Friedensbeginn? Bayern 1918 bis 1923, Darmstadt 2018
- Südfrüchte im Stahlnetz. Der polizeiliche Zugriff auf nichtpolizeiliche Datenspeicher in der Bundesrepublik, 1967-1989, in: Frank Bösch (Hg.): Wege in die digitale Gesellschaft. Computernutzung in der Bundesrepublik 1955–1990, Göttingen 2018, S. 39-63.
- Parteisoldaten mit Manager-Gehabe. Führungspraktiken im zentralen Parteiapparat der SED, in: Frank Bösch und Martin Sabrow (Hg.): Zeit-Räume 2018. Potsdamer Almanach des Zentrums für Zeithistorische Forschung, Göttingen 2018, S. 34–46
- mit Jens Gieseke: Introduction: Communist Parties Revisited, Sociocultural Approaches to Party Rule in the Soviet Bloc, 1956–1991, in: ibid. (eds.): Communist Parties Revisited, 1–22
- True Believers Becoming Funded Experts? Personnel Profile and Political Power in the SED Central Committee’s Sectoral Apparatus, 1946–89, in: Bergien/Gieseke (eds.): Communist Parties Revisited, 190–210
Das Schweigen der Kader. Ehemalige Nationalsozialisten im zentralen Parteiapparat der SED, in: Birthe Kundrus und Sybille Steinbacher (Hg.), Kontinuitäten und Diskontinuitäten. Der Nationalsozialismus in der Geschichte des 20. Jahrhunderts, Göttingen 2013, 134–153
- wiederabgedruckt in: Frank Bösch und Martin Sabrow (Hg.): Zeit-Räume 2014. Potsdamer Almanach des Zentrums für Zeithistorische Forschung, Göttingen 2014, S. 34–46
- Die Soldaten der "schwarzen Reichswehr". Motive für den Dienst in Grenz- und Landesschutz zwischen 1918 und 1933, in: Christian Th. Müller und Matthias Rogg (Hg.), Das ist Militärgeschichte!, Paderborn u.a. 2012,
83–102 - Erstarrter Bellizismus. Die SED-Funktionäre und ihr Weg in den Herbst '89, in: Martin Sabrow (Hg.), Das Wunder der friedlichen Revolution. "1989" und die Rolle der Gewalt, Göttingen, 33–55
- "Parteiarbeiter". Die hauptamtlichen Funktionäre der SED, in: Jens Gieseke/Hermann Wentker (Hg.), SED-Geschichte zwischen Mauerbau und Mauerfall, Berlin, 164–187
- Paramilitary Volunteers for Weimar Germany’s "Wehrhaftmachung". How Civilians Were Attracted to Serve with Clandestine Military Units, in: Christine Krüger and Sonja Levsen (eds.), War Volunteering in Modern Times, Basingstoke 2011, 189–211
- mit Ralf Pröve, Militärische Mobilisierung, gesellschaftliche Ordnung und politische Partizipation: Eine Einleitung, in: dies. (Hg.), Spießer, Patrioten, Revolutionäre, 11–25
- Mit "Kreiskommissaren" zur "Volkswehr". Die preußischen Einwohnerwehren als Organ einer republikanischen Sicherheitspolitik, 1918–1920, in: ders./Ralf Pröve (Hg.), Spießer, Patrioten, Revolutionäre, 117–138
- Das Leitbild der "Landesverteidigung". Legitimations- und Mobilisierungskonzept nach 1806, 1918/19 und 1945/49, in: Karl-Heinz Lutz/Marcus von Salisch (Hg.), Kriegsenden, Nachkriegsordnungen und Militärreformen im 19. und 20. Jahrhundert, München 2010, 463–484
- Republikschützer oder Terroristen? Die Freikorpsbewegung in Deutschland nach dem Ersten Weltkrieg, in: Militärgeschichte (2008), 3, 14–17
- "Bürokratischer Militarismus" in der preußischen Provinz. Die Kirchhainer Affäre von 1928 und die Zivilbehörden, in: Geschichte in Wissenschaft und Unterricht 59 (2008), 9, 476–491
Vorspiel des "Vernichtungskriegs"? Die Ostfront des Ersten Weltkriegs und das Kontinuitätsproblem, in: Gerhard P. Groß (Hg.), Die vergessene Front – der Osten 1914/18. Ereignis, Wirkung, Nachwirkung, Paderborn [u.a.] 2006, 393–408
- englischer Wiederabdruck als: Prelude to the War of Annihilation? The Eastern Front of the First World War and the Problem of Continuities, in Gerhard P. Groß (ed.): The Forgotten Front. The Eastern Front 1914/15, The Event, its Impact, and After Effects, Lexington, KY, 2018
- Flotte und Medien im Kaiserreich, in: Werner Rahn (Hg.), Deutsche Marinen im Wandel. Vom Symbol nationaler Einheit zum Instrument internationaler Sicherheit, München 2005 (= Beiträge zur Militärgeschichte, 63), 143–160
- Erinnern an Dennewitz. Eine Schlacht der Befreiungskriege und ihre Deutung in zwei Jahrhunderten, in: Zeitschrift für Geschichtswissenschaft, 53 (2005), 101–117
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